Dovetail Genomics 是一家位于圣克魯斯的初創生命科學公司,致力于開發基因組學技術,以改善基因組組裝、揭示關鍵的結構變異信息以及基因組學中的許多其他令人興奮的應用。
dovetailgenomics 21007說明書
反應 | 8 |
驗證樣本 | 哺乳動物細胞 |
技術 | Hi-C, ChIP-seq |
標簽 | 僅供研究使用 |
應用程序 | 蛋白質定向染色質構象、基因調控和新型增強子和超級增強子的發現 |
Dovetail™ HiChIP MNase Kit 結合了 ChIP-seq 和 Hi-C 的優點,Hi-C 是一種鄰近連接方法,使用標準的 Illumina 雙端測序捕獲長距離相互作用,使研究人員能夠查詢由特定蛋白質介導的蛋白質定向染色質構象。興趣。
除抗體外,該試劑盒提供了在生成 NGS 文庫之前對哺乳動物樣本進行染色質免疫沉淀和鄰近連接步驟所需的所有試劑。該試劑盒與用于 Illumina 的 Dovetail™ 文庫模塊(貨號 #25004)和用于 Illumina 測序的第 3 方標準雙端文庫制備試劑盒兼容。
Dovetail HiChIP Kit 具有以下主要優勢:
在單個庫中同時捕獲 ChIP-seq 和 Hi-C 數據
推出更多即用型抗體
以核小體水平分辨率繪制染色質相互作用圖
從樣品到測序就緒文庫的簡單三天工作流程
與其他類似方法相比,Dovetail HiChIP 工作流程具有多項優勢:
染色質的酶促和均勻裂解
來自鄰近結扎的遠程信息的豐富
穩健性和重現性低至一百萬個細胞輸入
經驗證的常見抗體清單
Dovetail™ Micro-C Proximity Ligation Assay 與 Dovetail HiChIP 方法的*組合使使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 能夠在鄰近連接之前均勻地分割染色質,沒有序列偏差,消除了對精細超聲處理程序的需要,并提供了染色質相互作用的最大分辨率(低至單核小體大?。?。
繪制蛋白質結合位點和長程蛋白質定向相互作用
Dovetail HiChIP Kit 能夠研究蛋白質導向的 3-D 染色質相互作用。與 ChIP-seq 類似,Dovetail HiChIP 數據捕獲由目標蛋白質直接結合的序列。然而,還捕獲了由感興趣的蛋白質介導的其他遠程相互作用。在測定中使用MNase 會產生核小體分辨率數據。
以較少的順序生成高分辨率的接觸圖
蛋白質導向染色質特征的富集使高分辨率接觸圖生成成為可能,但讀取深度更小。與基于高分辨率限制性內切酶的 Hi-C 相比,Dovetail HiChIP 數據能夠以讀取深度的一小部分顯示高階染色質特征,例如環和染色質相互作用,從而顯著節省測序成本。
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